В Африке распространяется штамм сальмонеллы, устойчивой ко всем лекарствам

main image main image

В Африке распространяется штамм сальмонеллы, устойчивой ко всем лекарствам

Интернациональная группа ученых из Института тропической медицины в Бельгии, Института биомедицинских исследований в ДР Конго, британского Института Сенгера и Кембриджского университета провела масштабное исследование нового вида сальмонелл, идентифицировав и изучив один из его штаммов, особо опасного для людей.

Статья об этом опубликована в журнале Nature Communications. Большинство сальмонеллезов дают симптомы, похожие на пищевое отравление.

В подавляющем большинстве случаев они не являются опасными для жизни.

Однако некоторые штаммы сальмонелл, в особенности S.

typhimurium, которые распространены в Африке к югу от Сахары, могут вызывать инвазивный нетифозный сальмонеллез (iNTS). iNTS - чрезвычайно опасное инфекционное заболевание крови.

Ежегодно нетифозным сальмонеллезом заражается 3,4 миллиона человек, из них более 680 тысяч - со смертельным исходом.

Профилактика и лечение таких инфекций в странах Африки осложнена ограниченным доступом к здравоохранению, проблемами инфраструктуры и ослабленным иммунитетом населения. Большинство случаев iNTS вызваны именно S.typhimurium.

Это относительно новый вид сальмонелл, который начал распространяться из двух отдельных очагов в Южной и Центральной Африке 52 и 35 лет назад соответственно.

В африканских странах наиболее распространенным является штамм ST313: он является мультирезистентным, то есть устойчивым к широкому спектру антибиотиков.

Наибольшей угрозой для людей является одна из двух клеточных сублиний этого штамма - ST313-II. Работая с образцами крови, взятыми в больницах Демократической Республики Конго от людей с подозрением на iNTS, исследователи отметили такие уровни устойчивости к антибиотикам, которые никогда ранее не наблюдались у S.typhimurium.

У этих бактерий в том числе была зафиксирована и устойчивость к азитромицину - антибиотику из группы резерва, который назначают в самых критических случаях. Результаты генетического секвенирования и анализа показали, что гены, обусловившие мультирезистентность сублинии ST313-II, присутствуют в одной и той же плазмиде.

Это вызывает особое беспокойство ученых, ведь плазмида - это мобильный генетический элемент, небольшая нехромосомная молекула ДНК, способная размножаться и передаваться в другие клетки.

При переносе таких плазмид ранее чувствительные к антибиотикам клетки и получают широкую резистентность. Физики научились контролировать и создавать кристаллы света Исследователи также изучили, как S.typhimurium становится "более агрессивной", переходя от форм, вызывающих кишечные инфекции, к формам, заражающим кровь.

"Мы наблюдали [такие же генетические] изменения в этой новой группе Salmonella typhimurium, которые ранее наблюдали у других инвазивных сальмонелл", - говорит одна из авторов исследования, биоинформатик Николь Уилер.

"Интересно то, что мы смогли подобрать эти изменения при помощи машинного обучения".

В будущем ученые намереваются создать на основе машинного обучения прогностический инструмент для контроля и отслеживания полирезистентных штаммов сальмонелл.