Его 44-летняя супруга Фабиана Флози родила мальчика в Швейцарии, его назвали Эйсом.
Во время беременности Фабиана и Берни находились в Бразилии, но приняли решение покинуть страну из-за сложной ситуации с коронавирусом.
У 89-летнего Экклстоун три дочери: младшей Петре 32 года, Тамаре 35 лет, а старшей Деборе 65 лет.